超星生物信息学_2课后答案(学习通2023课后作业答案)

分类： 法学习题发布于：2024-06-02 12:50:55ė06719次浏览682条评论

超星生物信息学_2课后答案(学习通2023课后作业答案)

第二章：生物数据库（第一部分）

单元测验02

1、超星FASTA序列格式以哪个符号开头？
A、生物>
B、信息学课习通<
C、后答#
D、案学*

2、课后从GenBank的作业哪一项注释中可以找到关于编码蛋白的信息？
A、SOURCE
B、答案RBS
C、超星CDS
D、生物ORIGIN

3、信息学课习通以下关于GenBank的后答描述，哪个是案学正确的？
A、GenBank里的课后一条数据库记录对应一个完整的基因。
B、作业GenBank里的一条数据库记录可能只包含某个基因的一部分。
C、真核生物的基因经常是分段存储在多条GenBank数据库记录里。
D、真核生物的基因都是整个存储在GenBank的一条数据库记录里。
E、原核生物的基因都是分片段存储在多条GenBank数据库记录里。
F、真核生物的基因以外显子为单位，一条数据库记录存储一个外显子。

4、以下哪个是NCBI下属的数据库？
A、GenBank
B、RefSeq
C、Gene
D、dbEST
E、Ensemble
F、HMP
G、ncRNA
H、Uniprot

5、关于HMP的描述，以下哪个是正确的？
A、HMP是人类微生物组学计划
B、HMP目前已包括人类所有器官的微生物宏基因组样本数据
C、HMP由J. Craig Venter Institute独立完成
D、HMP是人类基因组计划

6、以下关于PubMed的描述错误的是
A、任何生命科学领域的论文都可以从PubMed下载全文
B、PublMed是生物医学文献数据库
C、PubMed提供文章摘要和全文链接
D、1965年以前的文献未收录在PubMed中

7、以下哪些数据库是核酸数据库？
A、GenBank
B、EMBL-ENA
C、DDBJ
D、Swissprot
E、TrEMBL
F、Uniprot
G、PDB
H、SCOP
I、CATH
J、NCBI-Gene

8、以下关系式正确的是？
A、1G=1,000,000K
B、1T=1,000G
C、1T=1,000,000M
D、1G=1,000M
E、1G=1,000,000M
F、1T=1,000,000K

9、GenBank数据库中的检索号（Accession）和基因座名（Locus）指的都是一条序列在数据库中的编号，他们永远都是相同的。

10、当一个序列发生了改变，它的GenBank检索号（Accession）不变，但会被赋予一个新的GI号。

11、对于GenBank的一条数据库记录，只要版本号（Version）增加，必然会产生一个新的GI号。

12、GenBank里的一个序列因发生变化而被赋予新的GI号时，检索号（Accession）和版本号（Version）都不发生改变。

第二章：生物数据库（第二部分）

单元测验03

1、以下关于Swiss-Prot数据库和TrEMBL数据库的描述错误的是：
A、Swiss-Port和TrEMBL同属于UniProtKB数据库
B、Swiss-Port是手动完成的注释，TrEMBL是自动完成的注释
C、Swiss-Prot包含的序列少，TrEMBL包含的序列多
D、TrEMBL数据量大，其中也包含Swiss-Prot里的序列
E、Swiss-Port是自动完成的注释，TrEMBL是手动完成的注释
F、TrEMBL数据量大，但并不包含Swiss-Prot里的序列

2、以下哪个生物数据库提供信号传导通路信息？
A、Swiss-Prot
B、Pfam
C、DDBJ
D、PDB
E、KEGG
F、OMIM
G、GenBank
H、KEGG Pathway

3、以下不是非冗余的蛋白质/核酸数据库的是：
A、RefSeq
B、UniProtKB TrEMBL
C、UniProtKB Swiss-Prot
D、UniRef

4、全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是：
A、UniProtKB
B、PDB
C、KEGG
D、OMIM
E、Pfam
F、CATH
G、Ensemble
H、DDBJ

5、PDB文件是如何存储蛋白质3D结构的？
A、通过存储GIF动画
B、通过存储氨基酸序列
C、通过存储全息影像
D、通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标

6、以下哪种方法解析的蛋白质结构不可以提交到PDB数据库？
A、X射线衍射法
B、核磁共振法
C、冷冻电子显微镜技术
D、计算方法预测的结构模型

7、以下哪些是蛋白质数据库？
A、Swiss-Prot
B、TrEMBL
C、PIR
D、DDBJ
E、GenBank
F、Ensemble
G、CATH
H、SCOP2
I、FlyBase
J、PDB

8、下列关于生物数据库描述正确的是：
A、NCBI-GenBank、EMBL-ENA和DDBJ这三个数据库的数据通过“国际核酸序列数据库 联盟（INSDC）实时共享
B、PIR、Swiss-Prot、TrEMBL、PDB均属于蛋白质序列数据库
C、Swiss-Prot和TrEMBL同属于UniProtKB，他们的区别是，前者是手动完成的注释， 后者是自动完成的注释
D、PDB、CATH、Ensemble这三个数据库都是蛋白质数据库
E、Swiss-Prot和TrEMBL同属于UniProtKB，他们的区别是，前者是自动完成的注释， 后者是手动-完成的注释
F、PIR、Swiss-Prott、TrEMBL均属于蛋白质序列数据库

9、以下哪些是关于蛋白质结构分类的数据库？
A、CATH
B、SCOP2
C、SCOP
D、PDB
E、Uniprot
F、PIR
G、Ensemble
H、KEGG

10、以下关于PDB数据库描述正确的是：
A、PDB数据库是一级蛋白质数据库
B、PDB数据库存储大分子的3D结构
C、PDB数据库里既包含蛋白质的3D结构，也包含核酸的3D结构，以及二者的复合体结构
D、PDB数据库里只包含实验方法解析的大分子3D结构
E、PDB数据库是二级蛋白质数据库
F、PDB数据库只储存蛋白质分子的3D结构
G、PDB数据库里既包含实验方法解析的大分子3D结构，也包含计算机预测结构模型
H、X射线衍射法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库

第三章：序列比较（第一部分）

单元测验04

1、以下关于转换和颠换描述错误的是？
A、A变T是颠换
B、A变G是转换
C、G变C是颠换
D、G变T是转换

2、假设两个蛋白质序列的相似度在20%左右，那么应该采用的PAM矩阵是？
A、PAM60
B、PAM80
C、PAM120
D、PAM250

3、假设你有两条亲缘关系近的蛋白质序列。为了更好的比较它们，最好使用下列哪个BLOSUM或PAM矩阵？
A、BLOSUM45或PAM250
B、BLOSUM45或PAM10
C、BLOSUM80或PAM25
D、BLOSUM10或PAM25

4、以下矩阵不属于蛋白质序列比对的替换积分矩阵的是?
A、等价矩阵
B、遗传密码矩阵（GCM）
C、转换-颠换矩阵
D、PAM矩阵
E、BLOSUM

5、根据下面的全局比对结果，计算出这两条序列的一致度。
A、40%
B、50%
C、60%
D、70%

6、根据下面的全局比对结果，计算出这两条序列的相似度。（是否相似参考下面的BLOSUME62替换记分矩阵） BLOSUME62替换记分矩阵
A、40%
B、50%
C、60%
D、70%

第三章：序列比较（第二部分）

单元测验05

1、BLAST是什么？
A、火箭发射系统
B、蛋白质数据库
C、双序列比对工具
D、数据库中搜索相似序列的工具

2、关于tBLASTn描述正确的是：
A、是一个核酸数据库
B、是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具
C、是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具
D、其搜索的数据库是蛋白质数据库
E、其搜索的数据库是核酸数据库
F、其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列
G、要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列

3、关于tBLASTx描述正确的是：
A、是一个蛋白质数据库
B、是一个核酸数据库
C、是一个为蛋白质序列进行相似性搜索的工具
D、是一个为核酸序列进行相似性搜索的工具
E、其搜索的数据库是蛋白质数据库
F、其搜索的数据库是核酸数据库
G、其搜索的核酸数据库里的核酸序列要先被翻译成6条蛋白质序列
H、要进行相似性搜索的核酸序列需要先被翻译成6条蛋白质序列

4、要在核酸数据库查询一段与某DNA序列可能编码的蛋白质最相似的序列，应选择：
A、BLASTn
B、BLASTp
C、tBLASTn
D、BLASTx
E、tBLASTx

5、如果你想通过一条蛋白质序列从蛋白质数据库中搜索出一个庞大的蛋白质家族，应该用：
A、psi-blastn
B、phi-blastn
C、psi-blastp
D、phi-blastp

6、序列 MGEGGLATA 符合正则表达式 { L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{ }代表除什么以外，[]代表其中之一，x代表任意字母，(3,7)代表3到7个前面的某字符。

7、序列 FGETAIII 符合正则表达式 { L}GEx[GAS][LIVM]x(3,7) 。其中{ }代表除什么以外，[]代表其中之一，x代表任意字母，(3,7)代表3到7个前面的某字符。

单元作业02

1、1. 用NCBI双序列比对工具Global align对下列两条蛋白质序列作全局比对（Needle算法），设置Match/Mismatch Scores：4，-5；Gap Costs：existence：4，extension：2。给出序列比对结果页面屏幕截图。说明两条序列的一致性、相似性分别多少？[1分] >seq_1 VKCRLNVLLWYQDAYGEVEINDGKLYDAYVSYSDCPEDRKFVNFILKPQLERRRGYKLFL DDRDLLPRAEPSADLLVNLSRCRRLIVVLSDAFLSRAWCSHSFREGLCRLLELTRRPIFI TFEGQRRDPAHPALRLLRQHRHLVTLLLWRPGSVTPSSDFWKEVQLALPRKVQYRPVEGD PQTQLQDDKDPMLILRGRVPEGRAL >seq_2 MLGQCTQTWHRVRKTTQEQLKRNVRFHAFISYSEHDSLWVKNELIPNLEKEDGSILICLY ESYFDPGKSISENIVSFIEKSYKSIFVLSPNFVQNEWCHYEFYFAHHNLFHENSDHIILI LLEPIPFYCIPTRYHKLKALLEKKAYLEWPKDRRKCGLFWANLRAAINVNVLATREMYEL QTFTELNEESRGSTISLMRTDCL

2、2. 用NCBI的标准BLAST搜索Swissprot数据库中与如下序列最相似的人[Homo sapiens]的序列，给出操作过程及结果（屏幕截图即可）。[1分] >seq LYFDLPWYVRMLCQWTQTRHRARHIPLEELQRNLQFHAFVSYSGHDSAWVKNELLPNLEKD DIQICLHERNFVPGKSIVENIINFIEKSYKSIFVLSPHFIQSEWCHYELYFAHHNLFHEGS DNLILILLAPIPQYSIPTNYHKLKTLMSRRTYLEWPTEKNKHGLFWANLRASINVKLVNQA EGTCYTQQ

第四章：分子进化与系统发生

单元测验07

1、以下哪个不是构建系统发生树的基本算法？
A、最大简约法
B、邻接法
C、最大似然法
D、从头计算法
E、Smith Waterman算法

2、在同一物种中的来源于基因复制的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源

3、来自于不同物种的由垂直家系（物种形成）进化而来的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源

4、通过基因水平转移，来源于共生或病毒的侵染而产生的同源蛋白属于？
A、直系同源
B、旁系同源
C、异同源
D、分支同源

5、按照达尔文进化论学说，下列叙述正确的是？
A、鹿和狼在长期的生存斗争中相互进行选择，结果发展了自己的特征
B、不同岛屿上的加拉帕戈斯地雀因岛上食物不同，都长着独特的喙部
C、食蚁兽的长舌是因长期添食树缝中的蚂蚁反复伸长所致
D、生活在地穴水中的盲螈，因长期不用眼睛而失去视觉

6、拉马克提出的法则包括下列哪些？
A、用进废退
B、获得性遗传
C、物竞天择
D、适者生存

7、要根据一大组哺乳动物所具有的同源蛋白序列建立系统发生树，可以选择下列哪些物种作为外类群？
A、乌龟
B、蛇
C、大肠杆菌
D、小鼠
E、人
F、猕猴
G、拟南芥

8、为20个物种中的某个特定同源基因做出分子树，发现这20个物种在该树的相对关系与在的生命系统树（物种树）中的相对关系完全不同，这说明以下哪些情况是可能的？
A、基因水平转移
B、受到了特殊环境变化的影响
C、分子树构建错误
D、该基因经历了特殊的演化过程

9、相似序列并不一定是同源序列。

10、相似序列一定是同源序列。

单元作业04

1、TIRAP is an adapter molecule associated with toll-like receptors (TLRs) of the immune system, which identify pathogen-associated molecular patterns. This protein is involved in the TLR4 intracellular signaling pathway. It activates NFkB, MAPK1, MAPK3 and JNK, which then result in cytokine secretion and the inflammatory response. 附件tirap.fasta是人Homo sapiens、猕猴Macaca fascicularis、大象Loxodonta africana、马Equus caballus、鸡Gallus gallus、袋獾Sarcophilus harrisii、爪蟾Xenopus tropicalis、河豚Takifugu rubripes、剑尾鱼Xiphophorus maculatus、斑马鱼Danio rerio十个物种的TIRAP蛋白质序列。请用MEGA7为这些序列构建一株NJ树。MEGA7用ClustalW方法做出的多序列比对结果截图（1分）。参数设置页面截图：步长检验（BOOTSTRAP）取值100，其他参数默认（1分）。构建出来的Original Tree截图（1分）。构建出来的Bootstrap consensus tree截图（1分）。说出Original Tree和Bootstrap consensus tree树枝的长短有什么区别（1分）。

第五章：蛋白质结构预测与分析（第一部分）

单元测验08

1、全世界唯一存储生物大分子3D结构的数据库是：
A、PDB
B、UniProtKB
C、KEGG
D、CATH
E、Ensemble
F、Pfam

2、PDB文件是如何存储蛋白质3D结构的？
A、通过存储蛋白质中每个原子的3D坐标
B、通过存储GIF动画
C、通过存储氨基酸序列
D、通过存储全息影像

3、以下关于PDB数据库描述正确的是：
A、PDB数据库存储大分子的3D结构
B、PDB数据库里既包含蛋白质的3D结构，也包含核酸的3D结构，以及二者的复合体结构
C、PDB数据库里只包含实验方法解析的大分子3D结构
D、PDB数据库只储存蛋白质分子的3D结构
E、PDB数据库里既包含实验方法解析的大分子3D结构，也包含计算机预测结构模型
F、X射线衍射法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库
G、核磁共振法解析的蛋白质3D结构不能提交到PDB数据库

4、以下哪些是解析蛋白质三级结构的实验方法？
A、X射线衍射法
B、核磁共振法
C、冷冻电子显微镜技术
D、从头计算法

5、DSSP可以根据蛋白质的氨基酸序列预测它的二级结构。

第五章：蛋白质结构预测与分析（第二部分）

单元测验09

1、以下不属于实验方法解析蛋白质三维结构的是？
A、X-射线衍射法
B、核磁共振法
C、冷冻电子显微镜法
D、从头计算法
E、同源建模法
F、穿线法

2、以下可用来预测蛋白质三维结构建模的软件是
A、QUARK
B、ITASSER
C、SWISS-MODEL
D、ROBETTA
E、Jpred
F、Verify3D
G、DSSP
H、ModFold

3、以下是蛋白质结构模型质量评估软件的是？
A、ModFold
B、PROCHECK
C、Verify3D
D、ProQ
E、Superpose
F、Jpred
G、DSSP

4、一条长度340的氨基酸序列，当无法找到一致度>30%的模板时，可以使用下列哪种方法预测它的三维结构？
A、ROBETTA
B、ITASSER
C、QUARK
D、SWISS-MODEL

5、蛋白质三维结构预测软件预测出的结构模型可提交到PDB数据库

6、蛋白质三维结构预测软件预测出的结构模型都可以直接使用，不需要验证质量

单元作业05

1、SeqA是鲨鱼肌红蛋白的氨基酸序列，用Swiss-Model（https://www.swissmodel.expasy.org/）全自动模式预测其三维结构模型，结果页面截图（1分）。保存第一个预测模型（Model 01），用ProQ（http://proq.bioinfo.se/cgi-bin/ProQ/ProQ.cgi）评估该模型质量（1分）。用VMD显示第一个预测模型（Model 01）的三维结构，Representation设置如下：（1）Drawing Method=NewCartoon（2）Coloring Method=Secondary Structure（3）Selected Atoms=all。 >SeqA MCDWDLINKVWAKVEEDLAGNGQTVLLRLFEEHPETKAHFPKFKDIPLGQLTSNADVKTHGNTVF KALGDVVKQKGKHASNLQALATTHINKHKIPPQNFTLITNVILKVFAEKFPGEMTAPAQEAFSKA FKAICSELEDLYKKGGFQS

第六章：高通量测序技术及应用

单元测验11

1、以下哪个方法是纳米孔三代测序方法？
A、Sanger sequencing
B、Roche 454
C、SOLiD
D、PacBio

2、课程中提到的猛犸象基因组计划是从哪里提取DNA进行的测序？
A、毛发
B、骨骼
C、肌肉
D、指甲

3、以下哪些属于高通量测序技术在医学研究中的应用？
A、遗传变异的检测及遗传病的筛查
B、基于测序技术的精准用药
C、基于高通量测序的产前筛查
D、新生儿耳聋基因筛查

4、从头测序技术是对未知基因组的物种进行基因测序。

5、基因组重测序技术可以测定物种基因的表达谱系。

6、任何已灭绝物种只要提取出其一定量的DNA就可以进行基因组测序


南宋时期木建筑的特征是屋顶坡度平缓、出檐远阔，斗拱大、立柱粗，整体上雄伟霸气。

A.关于周围神经系统有髓神经纤维的叙述下列哪项错误
B.煤表面吸附氧气速率，与表面遮盖率的大小成正比。
C.“不良反应尚不明确”表明（ ）
D.长期蹲位工作的煤矿工人出现半月板损伤，其致伤外力多为（ ）


下列哪项不属于设备巡视分类

A.述职报告不能写成工作业绩报告，不能只谈业绩，还要写教训或失误。
B.哈曼认为先验想象力作为感性和知性的共同根源,植根于()之中。
C.苏轼自称“东坡居士”，此雅号与宋代哪个地方有关 【 】
D.哪一本书中提到了黑暗森林理论()


TN-S系统是指系统中的工作零线N线与保护零线PE线合在一起的系统。

A.在一个植物拉丁学名中，“var.”表示这是某一种植物的。
B.为切除故障线路，双侧电源线路两侧均需装设
C.当厂商存在经济亏损时，准租金（ ）
D.我们肉眼看到的光是太阳辐射的哪一部分（）


在电动机的继电器接触器控制电路中，自锁环节的功能是

A.下列关于白癜风描述错误的是（）
B.平面力偶矩的大小与矩心点的位置有关。
C.双因素方差分析是指涉及()
D.要比较数据间的多少关系,应选择的图表是


4783dd627a2b4a48aeae452672c76835.png

A.下列关于PubMED数据库错误的说法是（　　　　）
B.老年公寓的设计要适当减少公共活动空间的面积。
C.下列关于红外吸收光谱的描述不正确的有（ ）
D.感光材料的保护层具有( D )或产生摩擦灰雾的作用。


根据规定，企业编制的财务报表至少应当包括( )

A.TCP拥塞控制算法主要包括（）
B.较高的工资率意味着闲暇变得相对昂贵，所以工资率提高的替代效应使劳动供给量增加。
C.《上海的狐步舞》是新感觉派作家施蛰存的代表作。（）
D.应用下列哪些方法可以达到避孕目的


在标准ASCII编码表中，数字码、小写英文字母和大写英文字母的前后次序是（）。

A.奇经八脉不具备下列哪项功能特点( )
B.中华文化的源头是（ ）。
C.《神奇的数字：7±2》的作者是（ ）。
D.下列项目中，属于补助的是（　 　）。


下列不属于布鲁姆教学目标认知领域的是（ ）

A.象纹在明清时期象纹在家具上已出现，多应用在（ ）。
B.进口关税应计入“管理费用”科目。
C.采用（ )设计模式可保证一个类仅有一个实例.
D.下列选项中，哪一项是由因果图转换而来（）


以下属于字形別解法的有：（ ）

A.若要将图形中的所有尺寸都标注为原有尺寸数值的2倍，应设定以下哪项
B.CBE为能够准确反映整个平衡体系中质子转移的数量的关系式。
C.植物园的选址首先需要考虑()问题。
D.下面的绩效考核因素中，不属于能力考核的因素是()。


蜻蜓的变态类型是（ ）。

A.影响恒速干燥速率的主要因素是（ ）。
B.劫持航空器罪，致人重伤、死亡或使航空器遭受严重破坏的，处死刑”，这
C.区分三种有粒白细胞的根据是
D.输入设备是用来向计算机输入命令程序和数据信息的设备。


在（ ）视图中可以对幻灯片进行移动、复制操作。

A.下列现象掩盖资本主义剥削实质的是：
B.下述哪种并发症主要出现于骨折早期
C.客户类型会影响客户开发的方法选择。
D.下列属于多媒体技术的主要特点的是（ ）。


上半空间的格林函数由( )部分构成。

A.一种难溶的电解质总是可以向更难溶的电解质转化。
B.智慧职教: EBV与下列哪几种疾病密切相关
C.作为一名有仁爱之心的中医，如果遇到贫穷的病人该如何应对
D.春秋战国乱世带来了社会各阶层人自我意识的觉醒


血红蛋白具备四级结构，而肌红蛋白仅有三级结构。

A.电控ABS由（ ）、（ ）和（ ）组成。
B.项目的某种风险，在风险概率—影响矩阵中的评价是“N”，则该风险可能的情况是
C.提出孙权与刘备联盟的是()。
D.在互联网上销售小众商品是没有机会赚钱的。


以经济人假设为基础的管理，其目的是：

A.语言是你与人交往时的一张名片，可以体现你的德才学识等综合素养。
B.配合物的手性类型有（ ）
C.马王堆导引术中，下面哪个动作需要前俯后仰（ ）
D.将各分量叠加求总量时，如果分量的参考方向与总量一致应取正，否则，取负（ ）。



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