尔雅计算机辅助药物设计_1课后答案(学习通2023题目答案)
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第一章测验
1、电影《我不是计算机辅计课药神》中的神药“格列宁”是用于治疗
A、心脏病
B、助药白血病
C、物设脑血管病变
D、后答肝硬化
2、案学计算机辅助药物设计的习通应用可以加快靶点发现的速度,还有？
A、增加药物的题目靶点
B、提高靶点的答案包容度
C、发现更多的尔雅靶点
D、提高靶点发现的计算机辅计课准确度
3、目前计算机辅助药物设计存在的助药问题
A、蛋白质结构三维结构的物设真实性和可用性问题
B、受体-配体相互作用的后答方式问题
C、设计的案学分子能否进行化学合成
D、药物体内转运、代谢和体内毒副作用问题
4、计算机辅助药物设计是应用量子力学、分子动力学、构效关系等基础理论数据研究药物对酶、受体等作用的药效模型,?从而达到药物设计之目的
5、目前已经可以纯粹依靠计算机设计出一个分子即成为新药。
6、先导化合物是通过各种途径、方法、手段获得的具有某种药理学或生物学活性的化合物。其不一定为实用的优良药物,可能因其药效不强、特异性不高、毒性较大等而不能直接药用,需要进行结构修饰和改造,使之成为实用的高效、低毒、可控的优良药物,这一过程称为先导化合物的优化。
第二章 CADD的前世
第二章测验
1、具有以下哪类结构母核
A、环丙二酰脲类
B、苯并二氮卓类
C、吩噻嗪类
D、丁酰苯类
2、阿司匹林解热作用机制是
A、抑制环氧酶，减少PG合成
B、抑制下丘脑体温调节中枢
C、抑制各种致炎因子的合成
D、中和内毒素
3、何处的水解开环是可逆的
A、1、2位
B、3、4位
C、4、5位
D、5、6位
4、药物作用的靶点包括
A、受体
B、离子通道
C、酶
D、内源性小分子物质
5、受体都有其内源性配体，如
A、神经递质
B、激素
C、自体活性物质
D、支原体
6、受体具有哪些特征
A、特异性
B、高亲和力
C、饱和性
D、可逆性
7、药物作用的特异性，取决于药物分子也就是配体, 与其受体结合的专一性
8、现代药物发现也有其局限性，其研究对象为“药物-疾病”关系而非“靶点-药物”关系。
9、体内能与受体特异性结合的物质，称为配体或配基
10、能够与药物结合产生相互作用，发动细胞反应的大分子或大分子复合物的物质称为受体
第三章 CADD的今生
第三章测验
1、建立QSAR模型，最常用的就是
A、单纯型算法
B、偏最小二乘法
C、最小二乘法
D、sample法
2、分子对接分类中适合考察比较大的体系是
A、刚体对接
B、半柔性对接
C、柔性对接
D、半刚体对接
3、分子对接方式中，不用考虑分子结构特性的是
A、柔性对接
B、半柔性对接
C、刚性对接
D、半刚性对接
4、关于药效团的描述以下哪个是正确的
A、是与药物活性有关的原子
B、是与药物活性有关的官能团
C、是产生活性的取代基
D、是能被受体识别和结合的三维结构要素的组合
5、一个蛋白质的结构是由其_____唯一决定的，通过已知一级结构，理论上足以获取二级和三级结构。
A、氨基酸序列
B、氢键数量
C、二硫键位置
D、立体特性
6、下列哪些是QSAR常用的参数
A、立体参数
B、结构参数
C、指示变量
D、电性参数
7、对接方法尚需解决的问题
A、溶剂化效应
B、分子的柔性
C、打分函数
D、构象选择
8、分子场分析法假定配基与受体的结合是共价的，两者的亲和力或配基的生物活性与配基分子周围的空间立体场或静电场有关。
9、药物与受体的结合强度取决于结合的自由能变化
10、广义来讲，任何带有孤对电子的原子，如氮、氧、氟、硫等，都可以作为氢
11、序列比对的结果可以作为两者之间一定存在同源关系的依据
学习通计算机辅助药物设计_1
一、概述
药物设计是一门旨在发现新药，改善现有药物的药效和副作用，提高药物的安全性、耐受性和依从性等特性的学科。
传统的药物设计是通过实验室试验来发现和优化药物分子，这种方法费时费力，成本高且效果不稳定。随着计算机技术的不断发展，计算机辅助药物设计(CADD)逐渐得到广泛应用。
CADD是指利用计算机模拟方法，结合分子生物学和化学知识，快速高效地进行药物发现、设计和开发的一种技术。它可以在体外或体内快速筛选和评估药物分子的活性、代谢、毒性、物理化学性质等特性，减少实验室试验的时间和成本，提高药物研发的成功率。
本文将介绍学习通计算机辅助药物设计课程的第一节课内容，主要包括药物发现的基本流程、药效团分析和分子对接等内容。
二、药物发现的基本流程
药物发现的基本流程包括以下几个步骤：
- 目标酶或受体的筛选和验证
- 药效团的筛选和优化
- 化合物的设计和合成
- 活性和毒性的评价
- 药代动力学和药效动力学的评价
其中，药效团的筛选和优化是药物发现过程中的关键步骤，本文将重点介绍。
三、药效团分析
药效团是指分子中对生物活性贡献较大的基团或片段，药物设计时需要选择和优化药效团来提高分子的生物活性。
药效团分析可以通过计算机软件进行，其中常用的软件包括Sybyl、MOE、ChemDraw等。
药效团分析的流程如下：
- 选择分子库和目标蛋白
- 对分子库中的化合物进行构象搜索和能量最小化
- 提取化合物中的药效团
- 对药效团进行聚类和分析
- 选择和优化药效团
药效团的聚类和分析可以通过统计学方法和机器学习算法进行，其中最常用的算法包括主成分分析、分层聚类、支持向量机(SVM)等。
四、分子对接
分子对接是指将小分子(如药物)与受体或酶的结构进行结合，并计算结合能，用于评估分子和受体之间的相互作用和生物活性。
分子对接的流程如下：
- 准备受体和配体的结构文件
- 对受体进行预处理和优化
- 对配体进行构象搜索和能量最小化
- 进行分子对接和能量计算
- 对复合物进行评估和分析
分子对接的软件包括AutoDock、Glide、Gold等，其中AutoDock是最常用的分子对接软件之一。
五、总结
计算机辅助药物设计是一种快速高效的药物研发技术，它可以在较短时间内筛选和评估大量药物分子，降低药物研发的成本和风险。本文介绍了药物发现的基本流程、药效团分析和分子对接等内容，希望对读者有所帮助。
学习通计算机辅助药物设计_1
一、概述
药物设计是一门旨在发现新药，改善现有药物的药效和副作用，提高药物的安全性、耐受性和依从性等特性的学科。
传统的药物设计是通过实验室试验来发现和优化药物分子，这种方法费时费力，成本高且效果不稳定。随着计算机技术的不断发展，计算机辅助药物设计(CADD)逐渐得到广泛应用。
CADD是指利用计算机模拟方法，结合分子生物学和化学知识，快速高效地进行药物发现、设计和开发的一种技术。它可以在体外或体内快速筛选和评估药物分子的活性、代谢、毒性、物理化学性质等特性，减少实验室试验的时间和成本，提高药物研发的成功率。
本文将介绍学习通计算机辅助药物设计课程的第一节课内容，主要包括药物发现的基本流程、药效团分析和分子对接等内容。
二、药物发现的基本流程
药物发现的基本流程包括以下几个步骤：
- 目标酶或受体的筛选和验证
- 药效团的筛选和优化
- 化合物的设计和合成
- 活性和毒性的评价
- 药代动力学和药效动力学的评价
其中，药效团的筛选和优化是药物发现过程中的关键步骤，本文将重点介绍。
三、药效团分析
药效团是指分子中对生物活性贡献较大的基团或片段，药物设计时需要选择和优化药效团来提高分子的生物活性。
药效团分析可以通过计算机软件进行，其中常用的软件包括Sybyl、MOE、ChemDraw等。
药效团分析的流程如下：
- 选择分子库和目标蛋白
- 对分子库中的化合物进行构象搜索和能量最小化
- 提取化合物中的药效团
- 对药效团进行聚类和分析
- 选择和优化药效团
药效团的聚类和分析可以通过统计学方法和机器学习算法进行，其中最常用的算法包括主成分分析、分层聚类、支持向量机(SVM)等。
四、分子对接
分子对接是指将小分子(如药物)与受体或酶的结构进行结合，并计算结合能，用于评估分子和受体之间的相互作用和生物活性。
分子对接的流程如下：
- 准备受体和配体的结构文件
- 对受体进行预处理和优化
- 对配体进行构象搜索和能量最小化
- 进行分子对接和能量计算
- 对复合物进行评估和分析
分子对接的软件包括AutoDock、Glide、Gold等，其中AutoDock是最常用的分子对接软件之一。
五、总结
计算机辅助药物设计是一种快速高效的药物研发技术，它可以在较短时间内筛选和评估大量药物分子，降低药物研发的成本和风险。本文介绍了药物发现的基本流程、药效团分析和分子对接等内容，希望对读者有所帮助。
